Биологическая химия реального пространственного соответствия форм
|
|
Скачать 0.55 Mb.
|
|
Биологическая химия реального пространственного соответствия форм: Физико-химические и биологические свойства белков определяются не только составляющими элементами, но и их пространственной структурой. Белковые тела как любые материальные объекты наделены определённой, строго заданной пространственной конфигурацией при физиологических значениях температуры, рН среды и т.д. окружающего пространства. При определённых условиях окружающего и собственного пространства белки могут денатурироваться и ренатурироваться с полным восстановлением исходной трёхмерной структуры и нативных свойств молекулы, включая биологическую активность. Считается, что пептидные связи определяют архитектонику и функции белков: пространственное расположение атомов углерода и азота (в пептидной связи = 0,132 нм), находящихся примерно в одной плоскости, под углом 109028, , одинарной связью (-C-N-, равной 0,147 нм) и двойной связью (-C=N-, равной 0,125 нм), а также имеют своеобразие полифункциональных радикалов несущих свободные NH2-; COOH-; OН-; SH- группы. Это определят пространственную структуру и многообразие функций молекул белка. Архитектонику и пространственные закономерности материальных, нематериальных, живых или некоторых объектов можно воспроизводить трансформером Рюмина для обнаружения, адекватного понимания и использования законов мер объёмного пространства. Практический пример: ТР может воссоздавать скрученность, замкнутость, разомкнутость, соединение, разъединение, объединение, заузлённость, самопересечение, изменения форм, конформации, трансформации и множество других пространственных реальностей. Такие задачи невозможно воспроизводить другими инструментами, например: решать гипотетически или с помощью известных инструментов. ^
Закономерности первичных линейных и (или) плоскостных и т.д. сборных или разборных структур адекватно изучать и проецировать с помощью ИУР и (или) ТР.
Пространственные закономерности вторичных структур (спирализация и конформации) удобно и адекватно изучаемы и применимы с помощью ИУР и (или) ТР на трёхмерном и (или) объёмном уровне. Наиболее изучены закрученные (т.е. имеющие топологические закономерности) по часовой стрелке (правостороннее вращение) альфа спирали. Каждый виток спирали имеет 3,6 аминокислотных остатка, шаг спирали 0,54 нм на виток, на один аминокислотный остаток 0,15 нм, угол подъёма спирали составляет 260, через 5 витков спирали (18 аминокислотных остатков) имеется математическая монотонная последовательность, конфигурация повторяется (повторяемость структуры 2,7 нм). Спиральные участки могут сочетаться с линейными и другими участками. Считается, что пространственная стабильность вторичной структуры обеспечивается водородными (между атомом водорода первой молекулы и атомом кислорода второй молекулы воды), а также главновалентными пептидными и дисульфидными связями. Бета структуры – две или более линейные полипептидные цепи располагаются параллельно или анти параллельно, и СО - группами соседних цепей образуя пространственно складчатый слой. Существует множество других пока непонятных и неотразимых плоскостным способом и логикой пространственных структур полипептидов и белков. Между вторичной и третичной пространственной структурой обнаружены ещё два уровня существования белковой молекулы: надвторичные структуры и структурные домены.
Пространственные закономерности третичных структур (их многообразие вращений вокруг ковалентных связей), например взаимная укладка и взаимодействие некоторых частей первичной и (или) вторичной структуры изучаемы ИУР и (или) ТР на трёхмерном и (или) объёмном уровне. Признано две основные формы пространственных конформаций (структурное состояние белка, которое может переходить без разрыва ковалентных связей в другое структурное состояние, например вращение, вокруг единственной связи) T- форму (напряжённая) с взаимным переходом в R- форму (расслабленная). Пространственный процесс укладки полипептидной цепи называется фолдингом. Обнаружены белки теплового шока, которые располагаются между N- концевым сигнальным пептидом и матричным белком которые названы шаперонами. Третичную структуру белка признано называть нативной конформацией.
Пространственные закономерности четвертичных структур, например взаимная укладка и взаимодействие (соединение и разделение) некоторых третичных структур (изменение физических параметров при изменении формы) изучаемы и применимы ИУР и (или) ТР на трёхмерном и (или) объёмном уровне.
С помощью ИУР и ТР можно изучать и проецировать пространственные закономерности структуризации и (или) трансформации например взаимную укладку и взаимодействие (соединение и (или) разделение) некоторых объединённых комплексов на трёхмерном и (или) объёмном уровне. Сложные белки: Различают Хромопротеины (пространство простого белка связано с окрашенным небелковым компонентом); Гемопротеины содержат небелковый компонент структурно сходный железо- (или магний) порфирины и различные по пространственному составу и структуре белки; Флавопротеины содержат связанные с белком простетические группы; Нуклеопротеины состоят из белков и нуклеиновых кислот; Липопротеины состоят из белка и простеической группы, представленной липидом; Фосфопротеины - фосфорная кислота связана сложноэфирной связью с белковой молекулой; Гликопротеины - простой белок или пептид имеет группу гетероолигосахаридов; Металлопротеины - биополимеры, содержащие белок и ионы металла или нескольких металлов. Очевидно, что формы первичных структур белков имеют строение сходное с топологическими проективными плоскостями «Н1,2,3…n» скрученное и полностью и (или) частично замкнутое пространство. Такое пространство обладает далеко не геометрическими свойствами и закономерностями, например проективной плоскости первого (H1) порядка ленты Мёбиуса (односторонние и (или) некоторые (двух или несколько сторонние) поверхности) бутылкой Клейна проективная плоскость второго порядка (H2), кольца Барромео и т.д. Дальнейшая структуризация пространства может изменять число (чётное, нечётное и (или) некоторое) и взаимоотношение поверхностей объекта, что скажется на его пространственном разделении или объединении. Разделение и (или) соединение замкнутого пространства в зависимости от числа витков (осевой чётности или не четности, например, относительно константы Пи) вращения плоскостей объекта будут получаться разные пространственные результаты: раздельные кольца, замкнутые, заузлённые, одно кольцо (но уже длиннее и уже или наоборот) и т.д., что демонстрирует ТР. Структуризации пространства объектов обладают такими свойствами и законами мер, которые отличаются от привычной геометрии, стереометрии, тригонометрии, изометрии и т.д. Проективные плоскости в топологии могут претерпевать изменения, происходящие в живых формах, иметь заузления, самопересечения, изменять число поверхностей в зависимости от изменения пространственной формы эти закономерности реально воспроизводимы только ТР. Нуклеиновые кислоты: ДНК это H3PO4 Дезоксирибоза – Аденин – Гуанин – Цитозин – Тимин. РНК это H3PO4 Рибоза – Аденин – Гуанин – Цитозин – Урацил. Разница заключается в углеводах: РНК – Рибоза, ДНК – Дезоксирибоза (которые могут находиться в бета и де- рибофуранозной форме) и пиримидиновых основаниях РНК – Тимин, ДНК – Урацил. Первичная структура нуклеиновых кислот - это порядок, последовательность расположения мононуклеотидов в полинуклеотидной цепи ДНК и РНК. Считается, что цепи стабилизируются 3,,5,- фосфодиэфирными связями. Основание – Пентоза – (Р) – Пентоза +( - Основание) – (Р) – Пентоза – Основание. РНК имеют одноцепочные полинуклеотидные цепи: 5, - Г – У – Г – А – А - … – У – Ц – Г – Ц – Ц – А - 3,. На одном конце (почти всегда) 5, свободный монофосфорный эфир. На противоположном конце содержится нуклеотид со свободными 2, – и 3, – гидроксильными группами. На данном этапе познания определены небольшие участки ДНК (отдельные фрагменты) на основании косвенных данных: по степени сблоченности нуклеотидных звеньев (изоплитов); по кинетике реассоциации (повторяющиеся последовательности нуклеотидов); по распределению минорных оснований; по последовательности палиндромов («обратно бегущие» последовательности или перевёртыши) в местах рестрикции (раздвоения (бифуркация), растроения (трифуркация) и т.д.). Трансформер Рюмина (ТР) оригинальный инструмент для воспроизведения, изучения и использования законов мер пространства (изоплитов, сблоченности, реассоциации, палиндромов и т.д.), которые не воспроизводимы другими известными инструментами и логикой. Частичные разъединения и соединения ТР (би, трифуркации и т.д.) длинны, ширины и (или) глубины в совокупности с: -вращениями и (или) частями вращения некоторого пространства и (или) множественных пространств; -изменениями направлений пространства, векторов, осей координат и т.д.; -искривления плоскостей; -пространственной комплиментарности (соответствия) объектов; Живые формы и составляющие их элементы имеют закономерности, которые воспроизводимы только ИУР и (или) ТР для изучения и практического приложения. вторичная структура нуклеиновых кислот Молекула ДНК пространственно состоит из двух цепей (каждая цепь имеет противоположную полярность), которые закручены вокруг одной оси образуя правовращающую биспираль, одна из которых 5, –> 3,, а другая 3, –> 5,, шаг спирали 3, 4нм (на этом участке укладывается 10 нуклеотидных остатков), диаметр молекулы 1,8 нм. Между собой цепи удерживаются водородными связями меду их азотистыми основаниями (азотистые основания находятся внутри, а фосфорильные и углеводные компоненты снаружи). Основания ДНК уложены парами: пурин из одной цепи и пиримидин из другой аденин (А) – (Т) тимин (обеспечивается двумя водородными связями) и гуанин (Г) – (Ц) цитозин (обеспечивается тремя водородными связями за счёт особенностей расположения функциональных групп азотистых оснований) имеющий термин «комплиментарность». За счёт длины водородных связей (около 3нм) комплиментарным оказываются не только отдельные основания, но и дезоксирибонуклеиновые цепи ДНК которые образуют пространственно компактную структуру, стабилизирующую всю молекулу (гидрофобные взаимодействия между комплиментарными основаниями, связанные в центре биспирали). Конфигурация биспирали ДНК изменяется пространственно от количественного содержания воды и ионной силы окружающей среды. Обнаружено 6 пространственных форм ДНК: A; B; С; D; E; Z. A – форма ДНК имеет смещение пар оснований от оси молекулы к периферии, что изменяет расстояние межу нуклеотидами (вместо 10 содержится 11 мононуклеотидов с длинной витка 2,8нм). Взаимно переходящие (при изменении концентрации соли и степени гидратации) в пространственном отношении A - и B - формы ДНК представляют собой правозакрученную биспираль, имеющую параллельно фосфодиэфирному остову сайты, где присоединяются белки (осуществляют регуляторные функции при экспрессии генов). Синтез РНК на молекуле ДНК т.е. пространственную транскрипцию выполняет А- форма ДНК. Синтез ДНК на молекуле ДНК т.е. пространственную репликацию или роль матрицы имеет В- форма ДНК. Зигзагообразная Z- форма ДНК имеет левозакрученное пространство, фосфодиэфирный остов располагается вдоль оси молекулы зигзагообразно. Пространственные структуры ДНК и РНК имеют перевернутые повороты «палиндромы», которые образуют структуры или вариации для внутрицепочечных и межцепочечных соединений и формированию на некоторых участках тройной спирали (регуляция экспрессии отдельных генов). С рибосомами взаимодействуют тРНК, которые имеют участки связывания с аминокислотами, ферментами и триплет (специфическая пространственная последовательность трёх нуклеотидов) называемая антикодоном который комплиментарен тринуклеотидной последовательности мРНК (кодону) он кодирует пространственное включение в белковую молекулу определённой аминокислоты. В соответствии с программой ДНК продукт транскрипции представлен единственной цепью, которая упакована в пространство вторичной структуры независимо от типа РНК. С помощью трансформ ТР реально изучаемы и применимы компактные и другие структурные организации (транскрипции, репликации, комплиментарности и т.д.) материального, нематериального или некоторого пространства. Изучение не только одной спирали (имеющей закономерности ленты Мёбиуса), а множества вариантов скрученности (числовые значения осевого вращения) и (или) объединения множества линейных, скрученных и других участков (палиндромов и т.д.) некоторого пространства. Комплиментарность (соответствие) зависит от взаимоположений и (или) сцепленности, заузлённости и других пространственных особенностей объекта, которые воспроизводимы ТР и не воспроизводимы другими известными инструментами. третичная структура нуклеиновых кислот Биспираль ДНК на некоторых участках может подвергаться дальнейшей спирализации с образованием суперспирали, открытой кольцевой формы и (или) взаимно переходить в линейную форму или сочетать разные пространственные формы. Замыкание пространства ДНК в кольцевую форму вызвано ковалентным соединением их открытых концов. Суперскрученная молекула ДНК человека имеет длину 5нм, в развернутом линейном виде она будет примерно 8см. В молекуле ДНК встречаются положительные и отрицательные супервитки с правосторонним и (или) левосторонним направлением пространства биспирали они могут соединяться с белками (гистонами) упакованными в бороздки обеспечивая пространственную стабильность третичной структуры всей молекулы. Суперспирализация может изменяться пространственно: разрывом одной из цепей, в обеих цепях биспирали или другим образом ДНКазой или интеркалирующими соединениями (встраивание плоских ароматических колец между стопками пар азотистых оснований ДНК). Нативные молекулы тРНК имеют третичную структуру в реальности отличную от изображаемой научными специалистами на плоскости (евклидова пространства) структуры «клеверного листа» за счёт компактного пространственного складывания. Существуют природные РНК, имеющие однотипную с ДНК структуру. Стабилизация общей пространственной конфигурации нуклеиновых кислот зависит от множества факторов окружающего пространства: ванн - дер-ваальсовые (диполь-дипольные и лондоновские) связи между азотистыми основаниями; рН среды; ионная сила; температура; давление; гравитация; излучения; поля и т.п. Суперспирализация не может отражаться или воспроизводится существующими инструментами и логикой геометрии. Закономерности суперспирализации можно воспроизвести только ТР и ИУР для изучения и применения в практических работах. Ферменты Известен феномен химического катализа, при котором некоторые реакции протекают с разной эффективностью (скоростью, временем, температурой и т.д.) или иначе, например выделение и накопление энергии или создания новых пространственных структур материального мира в присутствии ничтожного количества примесей, как будто не участвующих в реакции. Напряжённость магнитного или некоторого поля, излучения, свет, время и т.д. изменяется благодаря пространственным закономерностям. С помощью ТР возможно изучать и воспроизводить пространственные структуры (объекты) способные изменять и (или) преобразовывать (фокусировать, рассеивать и т.д.) излучения, поля, время и другие явления. С помощью ТР можно создавать пространственные структуры способные изменять один вид энергии или материи в другой. Ферменты имеют белковую природу и пространственные особенности: каталитический центр, вступающий в химическое взаимодействие с субстратом, связывающий центр (контактную «якорную» площадку) для формирования комплекса и специфического сродства. Считается, что пространственное формирование активного центра фермента происходит при синтезе на рибосоме из линейной одномерной структуры пептидной цепи сначала в двухмерную, трёхмерное тело, которое приобретает необходимую объёмную укладку в пространстве. Объёмный белок приобретает другие физико-химические, функциональные и т.д. свойства, от одно, двух, трёхмерного прототипа. В пространстве молекулы фермента может присутствовать аллостерический (от греческого allos- другой, иной и steros- пространственный, структурный) центр или несколько аллостерических центров. Это участок молекулы фермента, с которым связываются некоторые (обычно низкомолекулярные) вещества называемые эффекторами или модификаторами. Пространственное взаимодействие эффектора и аллостерического центра изменяет третичную и другие структуры молекулы фермента тем самым изменяет конфигурацию активного центра его физические и химические свойства и (или) энзиматической активности. Аллостерические ферменты содержат и эффекторные центры, в которых субстрат не подвергается каталитическим изменениям, он влияет на каталитическую эффективность активного центра. Изоферментами (изоэнзимами) называются отличные по физическим и химическим свойствам, например сродство к субстрату, активности, электрофоретической подвижности или регуляторным свойствам множественные пространственные формы фермента, катализирующие одну и ту же реакцию. Существуют пространственные формы ферментов, которые состоят из нескольких субъединиц (протомеров), обладающих одинаковой или разной структурой, объединение которых в олигомерную молекулу создаёт мультимер. Особенность мультимеров заключается в зависимости активности комплекса от взаимного пространственного расположения его субъединиц. Мультимолекулярные ферментативные системы это надмолекулярные комплексы, состоящие из разных ферментов катализирующих в некотором пространстве последовательные ступени субстрата. Они имеют определённый порядок расположения каталитически активных белков в пространстве и времени. Между пространством фермента и субстрата по теории «индуцирования соответствия» формируется комплиментарность и электростатическое соответствие (противоположно заряженные группы). Активность ферментов зависит от пространственной конформации молекулы, которая зависит от множества факторов (температура, рН и т.д.) окружающего пространства. Ингибиторы ферментов изменяют (обратимо или необратимо) пространственную структуру молекулы или модификацию функциональных групп. Трансформер Рюмина использует возможности присоединения и (или) разъединения некоторых отдельных и (или) множества объектов и (или) частей. С помощью ТР можно исследовать закономерности образования мультимерных объектов и (или) взаимодействие направлений пространства, различных систем координат и т.д. С помощью ТР можно изучать и воспроизводить пространственные структуры с эксклюзивными свойствами, которые не доступны логике современных технологий. Компартментализация это разделение (с помощью биомембран) в пространстве и времени несовместимых метаболических процессов. Углеводы Моносахариды Число пространственных стереоизомеров моносахаридов выражается формулой N = 2n , где N – число стереоизомеров, а n- число ассиметричных атомов углерода. Изомеры моносахаридов имеют в пространстве D- и L- формы (или конфигурации) и оптическую активность (вращение плоскости поляризованного луча света вправо обозначение (+), влево (-)). В пространстве циклические формы моносахаридов имеют специфическую величину удельного вращения (поляризованного луча света), которая при растворении постепенно меняется (мутаротация), при длительном стоянии раствора появляются устойчивые значения, т.к. возникает пространственно новый асимметрический центр образования полуацеталей. Пространственная мутаротация обусловлена тем, что циклическая форма (полуацетальная) через альдегидную форму переходит в другие тауомерные циклические формы до достижения некоторой пространственной стабильности. Шестичленные кольца сахаров называют пиранозами, пятичленные – фуранозами. Написание структурных формул углеводов геометрически предложил в 20-х годах У. Хеурос: проекционные кольца лежат в горизонтальной плоскости ближние связи изображают жирными линиями (углеродные атомы цикла не пишут); заместители справа от остова молекулы (при вертикальном изображении) помещают ниже плоскости кольца, заместители слева выше плоскости кольца; D- сахара группу CH2OH пишут над этим атомом углерода, а водородный атом при нём внизу; гидроксильная группа при С-1 располагается ниже плоскости кольца в альфа форме, и выше в бета форме. Мутаротация в этом случае непредсказуема т.к. трёхмерная укладка и объёмные взаимодействия не отразимы или ошибочны в геометрической плоскости. Пиранозные кольца принимают в реальном пространстве конфигурации кресла (более устойчивая форма) или лодки в отличие от изображения шестиугольника в евклидовом пространстве. Изломанное пространство Финслера анизотропное (каждое направление отличается) тоже принимает различные пространственные формы и отличается от евклидового изотропного (все направления одинаковы) пространства, что не одно и тоже относительно оси времени, мировой линии или метрике пространства. Изучение конформаций и трансформ ТР доказывает, что изменение (соединение, разъединение и (или) разворот замкнутого пространства) формы в пространстве может изменять число поверхностей (переход в одно, двух, много поверхностные варианты) объекта. Например: при разрезе ленты Мёбиуса вдоль до полного разделения вращение плоскости ленты изменяется с 1Пи (нечётное) на 2Пи (чётное), при пространственном развороте этой замкнутой ленты можем получить 3Пи (нечётное) или 4Пи (чётное) или другое число. Нечётное число константы Пи осевого вращения ленты Мёбиуса будет «скрадывать» поверхность ленты в этом случае лента имеет одну поверхность (для условного верха и низа), чётное число будет «освобождать» вторую поверхность (появляются условные верх и низ) ленты. Чётное или нечётное число поверхностей или скрученности (относительно константы Пи или других величин) изменяет пространственные результаты разделения или объединения. Например: - по закону геометрии, разделив целый объект, всегда получим части. - по законам топологии, разделив целый объект, можем получить множество других вариантов: распадающиеся на отдельные; другие целые; сложно соединённые, переплетённые; объединённые и т.д. объекты. Таким объектам на сегодня очень сложно дать определение целое это или части и т.д. Олигосахариды пространственно содержат от 2 до 10 остатков моносахаридов имеющих гликозидные связи. Полисахариды – высокомолекулярные продукты пространственной поликонденсации моносахаридов, имеющие гликозидные связи с образованием линейных или разветвленных цепей. Липиды Название жирной кислоты (обычно) происходит добавлением к названию углеводородного окончания –овая (ненасыщенные кислоты –ановая, насыщенная -еновая). Когда жирная кислота находится в кристаллическом состоянии её принято изображать аксиально (геометрически) в виде зигзагообразной вытянутой линии с жёсткостью валентного угла атома углерода 1110 для насыщенной; 1230 – для двойной связи. В растворах жирно-кислотная цепь имеет бесчисленное многообразие пространственных конформаций (клубки и т.д.) образуя мицеллы. В мицеллах отрицательно заряженные карбоксильные группы жирных кислот пространственно обращены к водной фазе, неполярные углеводородные цепи спрятаны внутри мицеллярной структуры, поэтому мицеллы имеют суммарно отрицательный заряд. Из-за взаимного отталкивания мицелл растворы образуют в пространстве суспензии (суспендированы). Наличие двойной связи в жирнокислотной цепи даёт ограниченное вращение углеродных атомов относительно друг друга, что даёт существование пространственных изомеров: цис- и (редко) транс- конфигурации. Только с помощью ТР можно воспроизводить, понимать и применять законы мер многообразия существования или сосуществования мицелл и суспензий. Стероиды можно отделить пространственно от жира путём омыления. Они имеют ядро из гидрированного фенантреном (кольца А, В и С) и циклопентаном (кольцо D). Молекулы стероидов могут иметь множество пространственных стереоизомеров (асимметрии), конформации кресла или лодки, по отношению друг к другу пространственно кольца могут находиться в цис- и транс- формах. Пространственные конформации изменяют метрику объектов и окружающего пространства. Витамины это незаменимые факторы, обеспечивающие нормальное развитие и адекватную скорость протекания в некотором пространстве биохимических и физиологических процессов живых клеток. Признано существование витаминоподобных веществ и антивитаминов. Гормоны Сохранение пространственной стабильности гомеостаза (некоторое постоянство внутренней среды живого) обеспечивается при помощи механизмов саморегуляции гормонами. Признаны гормональные группы: пептидные, белковые, производные аминокислот; стероидные (жирорастворимые), эйкозаноиды (производные полиненасыщенной жирной кислоты). Биомембраны Углеводы мембран представлены в виде составных частей взаимодействия пространства сложных белков (гликопротеинов) и липидов (гликолипидов). Нуклеиновые кислоты в пространство мембранных структур обычно не включаются, но могут иметь ассоциации с мембранами. Мембраны ассиметричны по строению, это даёт кривизну и замкнутость пространства образуемых структур. Наружные пространства мембраны клеток отличаются от внутренних по составу и микровязкости (подвижность в латеральном направлении), набором ферментов и рецепторов. С помощью ТР можно изучать и применять: - пространственные свойства натуральных или некоторых объектов, элементов, многообразия и множественности уровней структуризации, - изменения физических, химических, временных, гравитационных и других известных взаимодействий, - изменения физического состояния различных излучений, полей и т.д. ТР воспроизводит такие пространственные закономерности как сцепление колец «Барромео»: два отдельных кольца сцепляются третьим таким образом, что все три кольца пространственно не распадаются. Каждое из трёх колец держит другое, необычность пространственной конструкции зацепления колец Барромео заключается в том что, убрав любое одно из колец (даже то которым не производилось пространственное зацепление), остальные два оказываются не сцепленными, т.е. распадаются, становясь независимыми в пространстве. Энергетика живой клетки определяется процессами во взаимодействиях пространства мембран и цитоплазмы. Взаимодействие пространственных изменений в результате воздействия света, субстратов и т.д. вызывают пространственные изменения в генерируемый потенциал (энергия АТФ). Энергия АТФ обратимо возникает на сопрягающих мембранах в результате разности пространственных потенциалов. Плотность зарядов, сконцентрированная в пространстве «хвоста» молекулы АТФ даёт лёгкую диссоциацию терминального фосфата при водном гидролизе на АДФ и неорганический фосфат и далее - АМФ и неорганический фосфат. Тканевое дыхание это распад органических соединений в определённых пространствах живых тканей с потреблением кислорода, выделением воды и углекислого газа, генерирования некоторой энергии в результате пространственных изменений моносахаридов до конечных продуктов в которые на разных стадиях включаются другие сахара и их производные, промежуточные продукты распада липидов, белков и нуклеиновых оснований. Гликолиз это совокупность реакций пространственных изменений глюкозы в пируват в результате окислительного декарбоксилирования пирувата в митохондриях ацетил-КоА вступает в цикл Кребса. Цикл трикарбоновых кислот (цикл Кребса) это общий конечный путь в пространстве окисления ацетильных групп (ацетил-КоА), а также взаимодействия пространственных переходов в процессе катаболизма некоторых органических молекул «клеточного топлива»: углеводов, жирных кислот и аминокислот. Пентозофосфатный путь окисления углеводов и гликолиз, протекающие в цитозоле пространственно взаимосвязаны, способны, взаимно переключатся в зависимости от соотношения концентраций промежуточных продуктов находящихся в клетке, он участвует в восстановительных биосинтезах РНК, ДНК, нуклеотидных коферментов. Существуют другие пространственные преобразования энергии и (или) материи, например анаэробный гликолиз с эффектом Пастера. С помощью ТР разного уровня (макро, микро и т.д.) можно изучать и применять пространственную механику и законы возникновения или изменения энергетических потенциалов взаимодействующих объектов имеющих разные и (или) одинаковые уровни структуризации. ТР применим для изучения и применения таких пространственных объединений и разъединений как эффекты колец Барромео, сборка или разборка бутылки Клейна из ленты Мёбиуса и т.д. Генетический код В нуклеотидном пространстве цепи (матричной) мРНК имеются кодовые «слова» для пространства каждой аминокислоты, которые заключаться в определенной последовательности расположения нуклеотидов молекулы ДНК. Большинство аминокислот (за исключением метионина и триптофана) кодируются несколькими кодонами, т.е. генетический код является вырожденным, что способствует пространственному «совершенствованию» генома в процессе точечной мутации возможны аминокислотные замены, которые отбираются в процессе эволюции. Считается, что код является линейным, однонаправленным и непрерывающимся (отсутствуют знаки препинания): АЦГУЦГАЦЦ он универсален для всех известных живых организмов. ДНК локализуется в ядре, рибонуклеиновые кислоты в ядре и цитоплазме. РНК синтезируется в ядре, поступает в цитоплазму, в которой является матрицей синтеза белка, который начинается с N- конца и завершается С- концом (NН2 -» СООН) в рибосомах. На последних стадиях пространственного синтеза белка происходит формирование третичной структуры и процессинг (придание строго определённого трёхмерного тела, наделанного функциональной информацией) объёмной молекулы полипептида. Сразу после трансляции или до окончания формирования третичной структуры происходит постсинтетическая или посттрансляционная модификация или трансформация пространства белковой молекулы. Белки, жиры и углеводы в живых клетках могут при необходимости взаимно изменяются друг в друга пространственно с помощью разных схем или переплетении реакций разных циклов (типов) например механизм взаимодействия мочевинообразование и ди- и (или) трикарбоновых кислот названный «велосипедом Кребса». Велосипед Кребса и другие закономерности пространственных взаимодействий можно воспроизводить ТР на необходимом уровне для изучения и использования в практических работах. Материальное, нематериальное или некоторое пространство постоянно усложняются во времени, вызывая многообразие уровней структуризации и взаимодействий некоторого пространства и суммарного пространства. С помощью ИУР и (или) ТР изучаемы и применимы законы мер (повторяющиеся или другие) структуризации и взаимодействия пространства разного (принятых на сегодня международной СИ (системой измерений) от йокто10-24 до йотта1024 и т.д.) уровня. Пространственные взаимодействия углерода как основы в виде белков, жиров, углеводов и т.д. дают множественные формы частей само производимых клеток, образований, органов, организмов или других структур которые во времени и пространстве целого демонстрируют эксклюзивные свойства живого, мыслящего, информационного поля и т.д. Некоторые поля – » Энергия – » Материя – » Неорганика – » Органика – » Аминокислоты – » ДНК –» РНК –» белок –» клетка –» симбиоз - образования –» орган –» организм –» индивид –» общество –» сообщество –» ноосфера – » информационное поле. Рассматривая только части некоторого материального без пространственных взаимодействий целого, которое является лишь частью другого взаимосвязанного целого, получаем ограниченность логики взаимодействия. «Многие вещи нам непонятны не потому, что наши понятия слабы; но потому, что сии вещи не входят в круг наших понятий» - Козьма Прутков |
Ваша оценка этого документа будет первой.
Ваша оценка:
Похожие:
База данных защищена авторским правом ©MedZnate 2000-2016
allo, dekanat, ansya, kenam
обратиться к администрации | правообладателям | пользователям
allo, dekanat, ansya, kenam
обратиться к администрации | правообладателям | пользователям