|
|
Скачать 1.85 Mb.
|
Род: “Marek’s disease-like viruses”. Типовой вид: Gallid herpesvirus 2 (GaHV-2) (герпесвирус куриных 2).Нуклеотидный и аминокислотный сиквенсы отличаются от таковых других представителей подсемейства. Вирусы данного рода были выделены только от птиц. Вызывают образование опухолей. Продукция инфекционных внеклеточных вирусных частиц ограничена эпителием перьевых фолликулов. Все представители проявляют перекрестную реактивность в серологических реакциях с вирусами данного рода. Виды (3 вида): Предполагаемые виды: нет.
Род: “Infectious laryngotracheitis-like viruses”. Типовой вид: Gallid herpesvirus 1 (GaHV-1) (герпесвирус куриных 1).Аминокислотный сиквенс единственного представителя данного рода показал его особое положение внутри подсемейства. Вид (1):
^ Macropoid herpesvirus 1 (MaHV-1) (Parma wallaby herpesvirus),Macropoid herpesvirus 2 (MaHV-2) (Dorcopsis wallaby herpesvirus), Psittacid herpesvirus 1 (PsHV-1)(Parrot herpesvirus) Подсемейство: Betaherpesvirinae. Нуклеотидный и аминокислотный сиквенсы представителей родов имеют различия. Гены, соответствующие гену US22 HHV-5, являются характерными для членов подсемейства. Вирусы имеют строгую специфичность виду-хозяину и типу культур клеток. Цикл репродукции медленный, вирус, как правило, клеточно-ассоциированный. У иммунокомпетентных хозяев инфекция обычно протекает инаппарантно. Латентная инфекция чаще связана с клетками моноцитарного ряда. ^ Типовой : Human herpesvirus 5 (HHV-5) (герпесвирус человека 5). Нуклеотидный и аминокислотный сиквенсы отличаются от таковых других представителей подсемейства. Геном цитомегаловирусов превышает 200 kbp. Инфицированные клетки увеличиваются (цитомегалия). Виды (3 вида):
Примечание: * - номер генома в генбанке [Х17403]. ^ Aotine herpesvirus 1 (AoHV-1) (Herpesvirus aotus 1) Aotine herpesvirus 3 (AoHV-3) (Herpesvirus aotus 3) Род: Muromegalovirus. Типовой: Murid herpesvirus 1 (MuHV-1) (герпесвирус мышиных ). Нуклеотидный и аминокислотный сиквенсы отличаются от таковых других представителей подсемейства. Размер генома муромегаловирусов превышает 200 kbp. Инфицированные клетки увеличиваются (цитомегалия). Виды (2 вида): Предполагаемые виды: нет.
^ Типовой вид: Human herpesvirus 6 (HHV-6) (герпесвирус человека 6). Геном розеоловирусов меньше, чем у других представителей подсемейства (менее 200 kbp). Вызывают продуктивную инфекцию Т-лимфоцитов. Выражено серологическое родство. Виды (2 вида):
^ Нуклеотидный и аминокислотный сиквенсы генов BNRF-1, BTRF-1 и BRLF-1 HHV-5 (соответствующие ORFs вируса Saimiriine herpesvirus 2 - ORFs 3, 23 и 50) отличают представителей данного таксона других представителей семейства. Многие члены подсемейства способны инфицировать in vitro лимфоциты, и образовывать латентно инфицированные культуры с небольшим числом клеток, инфицированных продуктивно. Латентная инфекция in vivo наблюдается в лимфоцитах и тканях лимфоидных органов. Острые инфекции часто ассоциируются с лимфопролиферативными нарушениями. Многие представители подсемейства ассоциируются с опухолями лимфоидного и нелимфоидного происхождения. ^ Типовой вид:Human herpesvirus 4 (HHV-4)(герпесвирус человека Нуклеотидный и аминокислотный сиквенсы отличаются от таковых других представителей подсемейства. Характрными для данного рода является ген EBNA вируса HHV-4 и его гомологи других вирусов. Вирусы инфицируют В-лимфоциты в культуре, но как правило непродуктивно, приводя к иммортализации. В-клетки или их предшественники являются местом латенции вируса in vivo. Члены рода обнаружены только у людей и нечеловекообразных приматов. Выражено серологическое родство. Виды (7 видов): Предполагаемые виды: нет.
Род: Rhadinovirus. Типовой вид: Saimiriine herpesvirus 2 (SaHV-2). Нуклеотидный и аминокислотный сиквенсы отличаются от таковых других представителей подсемейства. Многие виды продуктивно инфицируют in vitro фибробласты, часто многих видов. Выделены от многих видов млекопитающих. Латентная инфекция наблдается в Т- или В-лимфоцитах. Виды (12 видов):
Примечание: * - EHV-2, первоначально обозначался как “цитомегаловирус лошадей”. Так как данный вирус является членом Gammaherpesvirinae, данное название было упразднено и используется только как синоним. ^ Leporid herpesvirus 1 (LeHV-1)(Cottontail rabbit herpesvirus), Leporid herpesvirus 2 (LeHV-2) (Herpesvirus cuniculi),Leporid herpesvirus 3 (LeHV-3) (Herpesvirus sylvilagus),Marmomid herpesvirus1(MarHV-2)(Woodchuck herpesvirus) (Herpesvirus marmota) ^ Callitrichine herpesvirus 1 (CalHV-1) (Herpesvirus sanguinum). Неклассифицированный род семейства: “Ictalurid herpes-like viruses”. Типовой вид: Ictalurid herpesvirus 1 (Channel catfish virus), (IcHV-1), [М75136]. Нуклеотидный и аминокислотный сиквенсы единственного члена данного рода напоминают таковые других герпесвирусов, и поэтому, он был выделен в отдельную груп. ^ Филогенетическое родство внутри семейства. Семейство Herpesviridae составляют представители, отличающиеся широким разнообразием, но которые, в то же время, имеют сходную морфологию. Данные анализов, основанных на серологических исследованиях или гибридизации нуклеиновых кислот, редко имеют решающее значение при определении родства между вирусами. Возрастающее значение данных по сиквенсам способствовало широкому использованию сравнительного анализа сиквенсов с целью распределения герпесвирусов по таксонам и молекулярно-филогентического анализа семейства. Понятие отдельной генетической группы определялось по двум критериям: 1) сравнение нуклеотидных и аминокислотных последовательностей консервативных генов герпесвирусов и 2) идентификация отдельных уникальных генов. Тем не менее, некоторые вирусы были отнесены к определенным таксонам на основе серологического родства. Использование данных критериев подкрепило достоверность существующей таксономической структуры семейства (подразделение на подсемейства). Однако на основе этих критериев были созданы дополнительные таксоны:
|