|
Скачать 2.71 Mb.
|
ҚАЗАҚСТАН РЕСПУБЛИКАСЫНЫҢ ДЕНСАУЛЫҚ САҚТАУ МИНИСТРЛІГІ ҚАРАҒАНДЫ МЕМЛЕКЕТТІК МЕДИЦИНА УНИВЕРСИТЕТІ МИНИСТЕРСТВО ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РЕСПУБЛИКИ КАЗАХСТАН КАРАГАНДИНСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ MINISTRY OF HEALTH OF THE REPUBLIC OF KAZAKHSTAN KARAGANDA STATE MEDICAL UNIVERSITY МЕДИЦИНА МЕН БИОЛОГИЯДАҒЫ ЗЕРТТЕУДІҢ МОЛЕКУЛЯРЛЫҚ-ГЕНЕТИКАЛЫҚ ӘДІСТЕРІ Халықаралық ғылыми-тәжірибелік конференцияның материалдары 23-24 ақпан 2012 ж. МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ ^ Материалы международной научно-практической конференции 23-24 февраля 2012 г. MOLECULAR AND GENETIC RESEARCH METHODS IN MEDICINE AND BIOLOGY Materials of international scientific-practical conference 23-24 February, 2012 Қарағанды 2012 ӘОЖ 575:61:57 Қ ![]() М 39 ҚММУ ректорының профессор Р.С. Досмағамбетованың жалпы редакциясында ^ И. С. Азизов, А. С. Кусаинова, Т. Т. Едильбаева, Н. У. Танкибаева, Л. Е. Муравлева, В. Б. Молотов-Лучанский, Б. Ж. Култанов, А. З. Муратова, Г. С. Кемелова, Н. А. Цаюкова, Е. С. Сербо (жинаққа жауапты хатшы). М 39 Медицина мен биологиядағы зерттеудің молекулярлық-генетикалық әдістері: Молекулярно-генетические методы исследования в медицине и биологии: Molecular and genetic research methods in medicine and biology: Халықар. ғыл.-тәж. конф. материалдары – Қарағанды: ҚММУ баспасы, 2012. – 176 бет. – қазақша, орысша, ағылшынша. ISBN 978-601-202-117-2 Жинақ Қазақстанның, Швейцарияның, Ресейдің және Белорусияның жұмыстарын қамтиды. Медицина мен биологияның жаңа молекулярлық-генетикалық зерттеулерінің негізгі аспектлерін қарастырады, атап айтсақ, патологиялық жағдайлардың даму механизмдерін зерттеудің молекулярлық-генетикалық әдістері, микробиологиядағы зерттеулердің молекулярлық-генетикалық әдістері, онкогеномика мен онкопротеомика саласындағы өзекті мәселелер. ^ ӘОЖ 575:61:57 ҚБЖ 28.04:5:28 ISBN 978-601-202-117-2 © ![]() ^ HTlab AG Anaerobic bacteria are important human pathogens most often causing mixed infections, which involve several aerobic and anaerobic bacteria in the same time. To isolate in pure culture and to identify them with classical methods or with the help of automated micro-methods is time-consuming and may result in misidentification on species level. The Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry (MALDI- TOF MS) has recently been introduced and validated in routine diagnostic laboratories for identification of aerobic bacteria isolated from clinical specimens. Only few studies deal with the use of this technique for human pathogenic anaerobic bacteria. Our aims were to investigate whether this technique can be used for identification of various anaerobic bacteria, how discriminative this technique is to differentiate closely related species and whether there are possibilities to type B. fragilis strains according to the presence of the cfiA gene responsible for carbapenem resistance. Altogether 504 anaerobic clinical isolates from different genera including Bacteroides, Prevotella, Fusobacterium, Clostridium, Peptostreptococcus, Finegoldia and some unidentified Gram-negative and Gram-positive anaerobic bacteria were investigated by MALDI-TOF MS in parallel with traditional identification methods and with rapid ID 32A ATB and API20 ANA (BioMerieux) identification systems. 95.2% of all isolates were unequivocally identified with MALDI Bruker Daltonic BioTyper software. Discrepant results were confirmed by 16S ribosomal DNA sequencing. Even difficult to distinguish species, such as B. fragilis and B. capillosus, were correctly identified. By including to the data-base of MALDI-TOF BioTyper newly sequenced anaerobic species, the discrepant results could be minimised. The careful analyses of the mass spectra of B. fragilis strains harbouring the cfiA gene and those which do not, could be distinguished. According to our investigation MALDI-TOF MS is a fast and reliable technique, which has the potential to replace conventional phenotypic identification of anaerobic bacteria in routine clinical microbiology laboratories and may be used to detect potential carbapenem resistant strains. ^ Карагандинский государственный медицинский университет Проблема онкопатологий является приоритетной для Казахстана, что нашло свое отражение в послании народу Президента Республики Казахстан Н.А. Назарбаева (2012 г.), где было указано, что первоочередным направлением в медицине является вопрос снижения заболеваемости и смертности от онкологических заболеваний. Рак молочной железы (РМЖ) относится к наиболее распространенной формой онкопатологий среди женщин по всему миру, занимая лидирующую позицию в структуре заболеваемости и смертности от онкологических заболеваний среди женщин . Известно, что большое количество факторов, таких как возраст, гормональный статус, алкоголь, диета, семейный анамнез и др. ассоциированы с раком молочной железы человека . В тоже время существует вирус-ассоциированные опухоли, где вирусные инфекции играют важную роль в малигнизации пораженных клеток. Имеются сообщения об онкогенной роли отдельных вирусов, таких как вирус MMTV-like (подобный вирусу опухоли молочной железы у мышей) , вирус папилломы человека (HPV) высокого канцерогенного риска . В 2009 году в качестве потенциального этиологического агента в развитии рака молочной железы был рассмотрен вирус Эпштейн-Барр . Согласно имеющимся на сегодняшний день данным, на современном этапе можно выделить три основных вируса которые могут быть вовлечены в развитие рака молочной железы – подобный вирусу рака молочной железы у мышей (MMTV-like), вирус папилломы человека (HPV) и вирус Эпштейн-Барр (EBV) ^ В 1980 г. Sarkar N.H. основываясь на данных иммунологии и молекулярной биологии предположил, что вирус ММТV может быть вовлечен в патологический процесс в организме человека . Интересным фактом, подтверждающим гипотезу о возможном влиянии вируса опухоли молочной железы у мышей (MMTV) и онкопатологией человека является то, что последовательность гена env вируса была обнаружена в 38% тканях молочной железы женщин с диагнозом РМЖ . В исследовании Hachana и др. (2008) было показана высокая распространенность наличия последовательности гена env вируса среди Туниских женщин с диагнозом рак молочной железы и достигала 74% . В тоже время, при наличии высокой распространенности нахождения различных последовательностей гена env MMTV вируса, до сих пор не понятно происхождение данных генетических элементов и отсутствуют достаточные доказательства об этиологической роли вируса MMVT в развитии рака молочной железы у женщин . Несмотря на распространенное мнение, что клетки организма человека не являются подходящими для вируса, в 2008 г. Indik S и др. показали способность клеток поддерживать репликацию вируса MMTV . В 2007 г. Melana и др. описали полную последовательность провирусной структуры ретровируса с 95% гомологии с геномом вируса MMTV, которую обозначили как человеческий вариант вируса MMTV (HMMTV). Предположительно, что данный вариант вируса MMTV играет роль в развитии рака молочной железы . Таким образом, несмотря на накопленные клинические данные, позволяющие связывать рак молочной железы и вирус MMTV, доказательная база на современном этапе не сформирована, что оставляет вопрос об участии MMTV вируса в патогенезе опухоли молочной железы открытым. ^ В 1990 г. появилось сообщение о взаимодействии вируса папилломы человека с эпителиальными клетками молочной железы человека, вызывая снижение потребности клеток в ростовых факторах . Di Lonardo и др. в 1992 г. сообщил о возможном влиянии вируса папилломы человека (ВПЧ) на развитие РМЖ, указав на высокую распространенность генома вируса папилломы человека 16 генотипа в тканях . После большого количества исследований вирус папилломы человека был определен в качестве весомого кандидата на роль онковируса в развитии рака молочной железы . В работах по исследованию генотипов ВПЧ в развитии рака молочной железы de Villiers и др. в 2005 указал генотипы16, 18 и 33 ВПЧ как основные . В ряде исследований роль доминирующего генотипа в канцерогенезе клеток молочной железы отводится 33 генотипу ВПЧ . Хотя с помощью метода гибритизации in situ HPV-33 ДНК пробы, было показано наличие генома ВПЧ 33 генотипа в ядрах раковых клеток молочной железы, в тоже время не удалось с помощью ПЦР обнаружить геном ВПЧ в клетках рака молочной железы , что также оставляет широкое поле для рассуждений о механизмах вирус-индуцированной малигнизации клеток опухоли. ^ Впервые Yasui Y в 2001 г. предположил гипотезу о возможной взаимосвязи между инфицированием вирусом Эпштейн-Барр в юношеском или взрослом периоде и повышенной частотой рака молочной железы . Считается, что вирус Эпштейн-Барр играет важную роль в инициации развития канцерогенеза. При инфицировании ВЭБ на более поздних стадиях развития рака, наблюдается повышение онкогенных свойств у опухоли, таких как инвазивность, развитие кровеносных сосудов и метастазирование . По мнению Perkins RS и др. обнаружение ДНК ВЭБ в тканях опухоли и отсутствие либо сниженное количество в периферической крови говорит в пользу наличие связи между вирусом и карциномой молочной железы . Trabelsi A и др. предположил о возможной причастности ВЭБ и двумя типами рака молочной железы – медулярной карциномой молочной железы и карциномой с лимфоидной стромой . Исследования, проведенные на аргентинских пациентах показали, что между вирусом Эпштейн-Барр и эпителиальными клетками различных подгрупп опухолей молочной железы наблюдается корреляция . Безусловно, в развитии рака молочной железы играет большое количество внешних факторов. Однако, вирус папилломы человека (ВПЧ), вирус рака молочной железы у мышей (возможно человеческий тип) (HMMTV) и вирус Эпштейн-Барр (ВЭБ), как инфекционные агенты, если и не являются этиологическими агентами в развитии онкопатологии молочной железы, то, по крайней мере, могут быть отнесены к факторам высокого канцерогенного риска. Литература 1. Remennick L., Breast screening practices among Russian immigrant women in Israel. Women Health 1999. 28: p. 29-51. 2. Collaborative Group on Hormonal Factors in Breast Cancer, Familial breast cancer: collaborative reanalysis of individual data from 52 epidemiological studies including 58,209 women with breast cancer and 101,986 women without the disease. . Lancet, 2005. 358: p. 1389-1399. 3. Ford CE, T.D., Deng Y, Ta T, Rawlinson WD, Lawson JS,, Mouse mammary tumor virus-like gene sequences in breast tumors of Australian and Vietnamese women. Clin Cancer Res 2003. 9: p. 1118–1120. 4. Lawson JS, Do viruses cause breast cancer? Methods Mol Biol. , 2009. 471: p. 421-38. 5. Amarante MK, W.M., The possible involvement of virus in breast cancer. J Cancer Res Clin Oncol, 2009. 135(3): p. 329-37. 6. Sarkar NH, Type B virus and human breast cancer. The role of viruses in human cancer. Elsevier, North Holland, 1980. 1: p. 207-235. 7. Zammarchi F, P.M., Piersigilli A et al,, MMTV-like sequences in human breast cancer: a Xuorescent PCR/laser microdissection approach. J Pathol 2006. 209(436-444). 8. Hachana M, T.M., Ziadi S et al ,, Prevalence and characteristics of the MMTV-like associated breast carcinomas in Tunisia. Cancer Lett, 2008. 271(2): p. 222-230. 9. Lawson JS, G.W., Whitaker NJ,, Viruses and human breast cancer. Future Microbiol 2006. 1: p. 33-51. 10. Indik S, G.W., Kulich P et al ,, Rapid spread of mouse mammary tumor virus in cultured human breast cells. . Retrovirology 2007. 4. 11. Kordon EC MMTV-induced pregnancy-dependent mammary tumors: early history and new perspectives. J Mammary Gland Biol Neoplasia 2008. 13(3): p. 289-297. 12. Band V, Z.D., Kulesa V et al ,, Human papilloma virus DNAs immortalize normal human mammary epithelial cells and reduce their growth factor requirements. . Proc Natl Acad Sci USA 1990. 87: p. 463-467. 13. Di Lonardo A, V.A., Marcante ML ,, Human papillomavirus in breast cancer. Breast Cancer Res Treat 1992. 21(2): p. 95–100. 14. Ong K, K.E., Putti TC ,, Detection of cutaneous HPV types 4 and 24 DNA sequences in breast carcinoma in Singaporean women of Asian ancestry. . Pathology 2009. 41: p. 436-442. 15. Akil N, K.A., Yasmeen A et al ,, High-risk human papillomavirus infections in breast cancer in Syrian women and their association with Id-1 expression: a tissue microarray study. Br J Cancer 2008. 99: p. 404-407. 16. Kroupis C, M.A., Vourlidis N et al ,, Presence of high-risk human papillomavirus sequences in breast cancer tissues and association with histopathological characteristics. Clin Biochem, 2006. 39: p. 727–731. 17. de Villiers EM, S.R., zur Hausen H et al,, Presence of papillomavirus sequences in condylomatous lesions of the mamillae and in invasive carcinoma of the breast. . Breast Cancer Res 2005. 7: p. 01-11. 18. Akil N, K.A., Yasmeen A et al ,, High-risk human papillomavirus infections in breast cancer in Syrian women and their association with Id-1 expression: a tissue microarray study. . Br J Cancer 2008. 99(404-407). 19. Khan NA, C.A., Koriyama C et al,, Human papillomavirus detected in female breast carcinomas in Japan. . Br J Cancer 2008. 99: p. 408-414. 20. de Cremoux P, T.M., Lebigot I et al ,, No evidence of human papillomavirus DNA sequences in invasive breast carcinoma. . Breast Cancer Res Treat 2008. 109: p. 55-58. 21. Yasui Y, P.J., Stanford JL et al ,, Breast cancer risk and “delayed” primary Epstein–Barr virus infection. . Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 2001. 10: p. 9-12. 22. Murono S, I.H., Tanabe T et al,, Induction of cyclooxygenase- 2 by Epstein–Barr virus latent membrane protein 1 is involved in vascular endothelial growth factor production in nasopharyngeal carcinoma cells. Proc Natl Acad Sci USA 2001. 98: p. 6905–6910. 23. Wakisaka N, M.S., Yoshizaki T et al ,, Epstein-Barr virus latent membrane protein 1 induces and causes release of Wbroblast growth factor-2. . Cancer Research, 2002. 62: p. 6337–6344. 24. Perkins RS, S.K., Marando C et al,, Analysis of Epstein–Barr virus reservoirs in paired blood and breast cancer primary biopsy specimens by real time PCR. . Breast Cancer Res, 2006. 8(6). 25. Trabelsi A, R.S., Stita W et al ,, Detection of Epstein–Barr virus in breast cancers with lymphoid stroma. Ann Biol Clin 2008. 66: p. 59–62. 26. Ribeiro-Silva A Epstein–Barr virus in breast carcinoma in Argentina. . Arch Pathol Lab Med 2005. 129(9). |